纯水在食品加工过程中，使用点非常广，使用的方式也各不相同。比如有做原料清洗、浸渍、调湿、溶解用途的，有用来碱液去皮、盐水护色、浮选、水力输送的，还有用来烫漂、预煮、糖化、发酵、调味液配置的，另外还有用于杀菌、冷却等工艺的。这么多的使用工艺，不同的使用方法，原料水中不同的成分会在加工过程中产生不同的影响.
什么样的水是合格的纯水？
现在我国通行的要求是各种食品厂生产用水必须符合我国《生活饮用水卫生标准》，这是最基本的要求，也是卫生规范强制性的要求。
那么，符合生活饮用水卫生标准的是否就是合格的水呢？
不见得。由于各种食品生产用水的使用需求不同、工艺不同，对水质的要求也不同。因此，为了保证食品品质，除食品加工用水水质满足饮用水标准外，仍需对水质的某些成分予以严格控制。饮料类用水、酿酒用水、制面包用水、制面条用水、制罐头用水、糖制品用水、制冰用水以及速冻食品用水等加工工艺对水中关键污染物都有相关的指标要求。比如制面条要求水的硬度小于20个ppm，制冰用水碱度要求小于50ppm等。
由于现有自来水、井水等中含有各中不利于食品制造的离子、有机物等，根据不同情况可以选用不同的工艺，有的只需要过滤出颗粒杂质，有的要脱除水的异味，有的要脱除水中的离子杂质。根据这些要求现在使用量比较大的可靠工艺是反渗透纯水处理工艺，其流程如下：
1、原水→原水加压泵→石英砂过滤器→活性炭过滤器→软水器（可选）→保安过滤器→一级反渗透设备→无菌纯水箱→纯水增压泵→紫外线杀菌器→微孔过滤器→EDI系统→无菌纯化水箱→臭氧杀菌器→纯化水增压泵→臭氧杀菌器→紫外线杀菌器→微孔过滤器→纯水用水点
2、原水→原水加压泵→石英砂过滤器→活性炭过滤器→软水器（可选）→保安过滤器→第一级反渗透→纯水箱→纯水增压泵→第二级反渗透→无菌纯化水箱→臭氧杀菌器→纯化水增压泵→臭氧杀菌器→紫外线杀菌器→微孔过滤器→纯水用水点